Mert Güncüer lisans öğrenimini Bilkent Üniversitesi İletişim-Tasarım bölümünde tamamladı. 2015 yılında Avrupa Birliği’nin de destek verdiği bir oluşum olan “Luksuz Produkcija” bünyesinde çalışmalarını sürdürdü. Burada dünyanın farklı yerlerinden sanatçılarla birlikte kısa film, video-clip ve belgesel türlerinde işler yaptı. 2021’de Kültür Bakanlığından aldığı destekle birlikte Çizginin İki Tarafı isimli ilk uzun metraj filminin çalışmalarına başladı. Aynı yıl bir diğer uzun metraj filmi olan ve Fuat Saka’nın hayatını konu edinen Bir Sürgünün Not Defteri: Misina belgesel filminin çekimlerine başladı. Çektiği filmlerle yurt içinde ve yurt dışında film festivallerinde yer aldı. 2020 yapımı Yarın&Yarın filmi ile Avrupa film pazarı, 43. Clermont Ferrand Kısa Film Festivali, Film Market, Türkiye Kataloğu ve 77. Cannes Film Festivali, Film Market, Türk Sineması Kataloğu’nda yer aldı. 2020 yılında Zamansız Zamanlar filmi ile Europe Film Festival U.K tarafından Jüri Özel – En İyi Sinematografi ödülüne layık görüldü
